电脑插个 U盘 就能给基因测序 实时查询结果
发布时间:2021-12-28 23:09:39 所属栏目:动态 来源:互联网
导读:现在,你也可以像黑客帝国里的Neo一样,查看构成自己和别人的源代码了。 然后连线插进电脑,再配合软件使用,就能近乎实时地查看你的DNA测序结果了: 这是一种叫做纳米孔测序 (Nanopore sequencing)的技术。 在这种方法里,未知序列的样品会被输送穿过一
现在,你也可以像黑客帝国里的Neo一样,查看构成自己和别人的“源代码”了。 然后连线插进电脑,再配合软件使用,就能近乎实时地查看你的DNA测序结果了: 这是一种叫做纳米孔测序 (Nanopore sequencing)的技术。 在这种方法里,未知序列的样品会被输送穿过一个直径1纳米的小孔。 以人类体液为样本,需要先利用酶“拉开”DNA分子的“拉链”,让一根单链进入纳米孔: 不同碱基的化学性质不同,这也就使得整条DNA链会在穿越纳米孔引起幅度不同的电流变化。 而这种电流信号的强弱,就能反映DNA样本的核酸序列信息。 而从牛津大学衍生而出的Oxford Nanopore公司,就将上述核心技术打包,塞进了这样一个尺寸10厘米的“U盘”之中: 根据官方的数据,理论上最大输出速度可达到420个碱基/秒,而从一个单元格中的样本最多可得到50GB的数据,准确率达到88%以上。 除了对专业的研究人员售卖以外,官方的简介中也表明,“没有大量实验室经验的人群也可使用”。 也有网友吐槽这只是“听起来很酷”,毕竟除非测序的对象是一个鸡蛋,否则得到的任何序列都只是你全体DNA的一个小子集而已。 最近,还有一位来自霍普金斯大学的教授基于这一产品做了进一步的开发,提出了一个叫做UNCALLED的程序。 在面对大型序列时,这一软件将序列内容与已知的基因序列进行匹配,快速挑选出所需的目标序列。 举个例子,研究人员想要确定一个人是否携带了遗传性癌症相关基因的变异(比如 BRCA1),就可以使用这一软件快速判断当前样本是否值得研究。 (编辑:海南站长网) 【声明】本站内容均来自网络,其相关言论仅代表作者个人观点,不代表本站立场。若无意侵犯到您的权利,请及时与联系站长删除相关内容! |
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